34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0790 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1141    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  60.22 
 
 
564 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  55.22 
 
 
559 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  53.86 
 
 
540 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  53.3 
 
 
546 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  50.27 
 
 
561 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  43.75 
 
 
558 aa  404  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  41.13 
 
 
545 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  41.25 
 
 
566 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  38.08 
 
 
587 aa  335  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  35.89 
 
 
569 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  38.78 
 
 
585 aa  329  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  36.43 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  36.43 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  36.43 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  36.65 
 
 
573 aa  323  4e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  35.3 
 
 
570 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  37.46 
 
 
573 aa  319  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  38.72 
 
 
599 aa  311  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  35 
 
 
582 aa  299  9e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  36.35 
 
 
563 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  36.38 
 
 
565 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  36.38 
 
 
565 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  35.08 
 
 
627 aa  296  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  35.75 
 
 
587 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  34.69 
 
 
643 aa  282  1e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  35.54 
 
 
629 aa  280  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  39.25 
 
 
567 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  35.5 
 
 
579 aa  259  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  34.25 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  34.44 
 
 
695 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  35.88 
 
 
672 aa  137  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  27.78 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  25.69 
 
 
389 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>