34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2734 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 599 aa  1195    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  59.63 
 
 		 569 aa  638    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  58.03 
 
 		 570 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  56.6 
 
 		 587 aa  618  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  58.96 
 
 		 563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  58.82 
 
 		 565 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  58.82 
 
 		 565 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  52.89 
 
 		 627 aa  577  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  47.54 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  43.96 
 
 		 585 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  44.8 
 
 		 587 aa  415  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  42.26 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  42.26 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  42.26 
 
 		 585 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  42.61 
 
 		 643 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  39.41 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  41.08 
 
 		 629 aa  360  4e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  41.53 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  41.34 
 
 		 573 aa  352  8e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  39.71 
 
 		 573 aa  349  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  39.59 
 
 		 559 aa  346  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  38.43 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  37.76 
 
 		 540 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  36.41 
 
 		 564 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  35.65 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  37.36 
 
 		 574 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  35.51 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  36.05 
 
 		 572 aa  277  4e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  34.5 
 
 		 558 aa  261  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  37.07 
 
 		 567 aa  258  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  34.63 
 
 		 695 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.6 
 
 		 672 aa  123  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  28.9 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  26.95 
 
 		 389 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>