34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2331 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1124    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  56.53 
 
 		 559 aa  615  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  59.4 
 
 		 546 aa  598  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  56.42 
 
 		 540 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  52.52 
 
 		 564 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  51.69 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  44.2 
 
 		 558 aa  411  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  41.51 
 
 		 545 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  39.29 
 
 		 566 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  37.11 
 
 		 570 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  36.11 
 
 		 587 aa  331  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  38.17 
 
 		 582 aa  329  9e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  36.72 
 
 		 569 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  36.67 
 
 		 585 aa  318  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  35.09 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  35.09 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  35.09 
 
 		 585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  35.15 
 
 		 599 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  36.76 
 
 		 563 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  36.67 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  36.67 
 
 		 565 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  35.4 
 
 		 587 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  34.7 
 
 		 573 aa  300  7e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  35.3 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  33.46 
 
 		 627 aa  296  9e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  35.51 
 
 		 643 aa  291  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  34.49 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  32.71 
 
 		 629 aa  274  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  32.81 
 
 		 567 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  30.49 
 
 		 572 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  32.35 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  31.56 
 
 		 672 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  27.8 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  22.51 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>