33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2875 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  766    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  39.81 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  31.77 
 
 		 566 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  30.31 
 
 		 573 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  29.67 
 
 		 587 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  30.04 
 
 		 627 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  27.78 
 
 		 573 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  30.8 
 
 		 563 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  30.19 
 
 		 587 aa  92.4  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  30.8 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  30.8 
 
 		 565 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  30.32 
 
 		 559 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  29.89 
 
 		 585 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  29.89 
 
 		 585 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  29.89 
 
 		 585 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  29.6 
 
 		 585 aa  88.6  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  27.86 
 
 		 545 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  28.9 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  28.46 
 
 		 582 aa  82.8  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  28.36 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  28.73 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  30.18 
 
 		 629 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  30.04 
 
 		 540 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  35.9 
 
 		 546 aa  76.6  0.0000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  28.52 
 
 		 567 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  28.52 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  28.46 
 
 		 564 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  27.17 
 
 		 643 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  27.92 
 
 		 579 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  25.27 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  28.14 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  29.8 
 
 		 572 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  31.3 
 
 		 672 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>