34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06490 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  100 
 
 		 572 aa  1121    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  40.23 
 
 		 582 aa  331  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  37.22 
 
 		 566 aa  320  6e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  36.91 
 
 		 643 aa  316  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  36.31 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  36.31 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  36.31 
 
 		 585 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  34.81 
 
 		 570 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  34.93 
 
 		 587 aa  292  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  34.48 
 
 		 573 aa  290  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  41.49 
 
 		 563 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  37.07 
 
 		 579 aa  287  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  41.71 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  41.71 
 
 		 565 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  35.61 
 
 		 569 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  35.37 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  48.34 
 
 		 567 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  36.12 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  32.54 
 
 		 587 aa  259  9e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  33.01 
 
 		 627 aa  256  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  34.09 
 
 		 629 aa  252  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  33.65 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  33.02 
 
 		 540 aa  233  5e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  32.27 
 
 		 545 aa  233  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  32.81 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  33.95 
 
 		 574 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  29.6 
 
 		 559 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  32.56 
 
 		 564 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  31.81 
 
 		 546 aa  206  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  29.6 
 
 		 561 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  29.67 
 
 		 695 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  28.39 
 
 		 672 aa  103  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  29.8 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  23.55 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>