34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4545 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1168    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1168    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  71.75 
 
 		 573 aa  792    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1168    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  71.7 
 
 		 573 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  48.48 
 
 		 629 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  45.44 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  41.92 
 
 		 570 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  41.84 
 
 		 585 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  43.17 
 
 		 587 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  42.11 
 
 		 569 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  41.64 
 
 		 587 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  43.04 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  41.61 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  41.79 
 
 		 599 aa  374  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  42.96 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  42.96 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  41.11 
 
 		 643 aa  368  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  38.17 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  40.75 
 
 		 627 aa  345  2e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  36.95 
 
 		 559 aa  339  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  38.35 
 
 		 540 aa  333  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  38.84 
 
 		 564 aa  323  7e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  40.26 
 
 		 567 aa  319  7e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  36.1 
 
 		 546 aa  317  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  36.43 
 
 		 574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  36.31 
 
 		 572 aa  298  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  35.39 
 
 		 545 aa  298  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  35.08 
 
 		 561 aa  293  8e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  34.43 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  34.87 
 
 		 695 aa  142  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  30.58 
 
 		 672 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2875  hypothetical protein  29.89 
 
 		 398 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3241  membrane protein-like protein  23.66 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>