32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04650  predicted membrane protein  100 
 
 		 695 aa  1357    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0020  hypothetical protein  48.36 
 
 		 672 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1631  hypothetical protein  33.51 
 
 		 573 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1627  membrane protein  35.1 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1027  hypothetical protein  34.21 
 
 		 546 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2734  hypothetical protein  34.63 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4545  hypothetical protein  34.87 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4632  hypothetical protein  34.87 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4928  hypothetical protein  34.87 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.864415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2200  hypothetical protein  33.56 
 
 		 559 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0720421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03810  predicted membrane protein  32.68 
 
 		 643 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.410543  normal  0.0896898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5118  hypothetical protein  32.02 
 
 		 573 aa  138  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0678631  normal  0.764833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0084  hypothetical protein  31.59 
 
 		 540 aa  133  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4958  conserved membrane-spanning protein  30.46 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0790  hypothetical protein  32.78 
 
 		 574 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2331  hypothetical protein  32.35 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4682  hypothetical protein  30.99 
 
 		 570 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3649  hypothetical protein  30.45 
 
 		 564 aa  125  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5234  membrane protein  29.19 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4388  hypothetical protein  31.27 
 
 		 565 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4232  hypothetical protein  31.27 
 
 		 565 aa  124  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4157  hypothetical protein  31.41 
 
 		 563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0644  hypothetical protein  29.18 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.190884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2035  hypothetical protein  30.4 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06490  predicted membrane protein  28.8 
 
 		 572 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2148  hypothetical protein  28.47 
 
 		 629 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1975  conserved membrane-spanning protein  33.06 
 
 		 567 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0739  hypothetical protein  29.13 
 
 		 582 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11087  hypothetical protein  29.79 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000146908  normal  0.370697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0938  hypothetical protein  30.45 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1832  hypothetical protein  32.6 
 
 		 558 aa  96.3  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.868946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27010  predicted membrane protein  29.82 
 
 		 579 aa  86.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.992293  normal  0.457922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>