More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0802 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0802  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  272  1.0000000000000001e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000681692  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  52.34 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  51.94 
 
 
132 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  45.52 
 
 
134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  43.61 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  46.56 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  131  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  43.85 
 
 
133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  46.56 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
131 aa  127  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  46.51 
 
 
132 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  44.53 
 
 
132 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  44.96 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  44.27 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
133 aa  124  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
132 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  47.29 
 
 
132 aa  124  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  45.8 
 
 
132 aa  124  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  47.69 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  45.38 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2243  30S ribosomal protein S8  48.84 
 
 
126 aa  123  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0125456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1404  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
130 aa  124  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
132 aa  123  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  47.29 
 
 
131 aa  123  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  41.86 
 
 
131 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  45.11 
 
 
132 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  45.74 
 
 
131 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  43.41 
 
 
132 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  43.51 
 
 
133 aa  121  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  120  4e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  41.09 
 
 
130 aa  120  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  44.19 
 
 
131 aa  120  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
132 aa  120  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  37.4 
 
 
132 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
133 aa  120  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  47.29 
 
 
126 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  44.7 
 
 
133 aa  119  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  39.69 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0674  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.973515  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2893  ribosomal protein S8  45.8 
 
 
131 aa  118  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  41.86 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  44.62 
 
 
133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  41.98 
 
 
132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  44.19 
 
 
132 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  41.09 
 
 
132 aa  117  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  41.67 
 
 
134 aa  117  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  41.86 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
132 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  41.98 
 
 
136 aa  116  9e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  44.62 
 
 
133 aa  116  9e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  42.64 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  42.75 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  41.22 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  41.09 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1751  30S ribosomal protein S8  45.74 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327993  normal  0.605139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  43.41 
 
 
132 aa  114  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0337  ribosomal protein S8  44.53 
 
 
130 aa  115  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000518879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 
131 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl137  30S ribosomal protein S8  44.27 
 
 
129 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  40.15 
 
 
135 aa  114  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  45.31 
 
 
131 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  39.85 
 
 
133 aa  114  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>