51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2327 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  306  6.999999999999999e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  52.32 
 
 		 152 aa  147  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  48.18 
 
 		 155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  43.31 
 
 		 165 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  46.43 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  42.14 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  43.07 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  46.28 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  44.6 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  42.34 
 
 		 154 aa  90.9  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  38.14 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  42.86 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  36.22 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  37.4 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  43.53 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  46.84 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  38.41 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  35.1 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  34.16 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  39.13 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  34.88 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  37.5 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  29.77 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  39.62 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  35.33 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  33.33 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  31.3 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  38.64 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  39.62 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  33.57 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  36.43 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  36.43 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  36.15 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  38.89 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  35.62 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  30.95 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  34.09 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  43.1 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1591  hypothetical protein  36.71 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>