42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0901 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  331  3e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  80.14 
 
 
164 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  65.54 
 
 
151 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  41.48 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  38.52 
 
 
151 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  38.52 
 
 
151 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  38.97 
 
 
152 aa  103  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  44.6 
 
 
157 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  46.58 
 
 
165 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  39.26 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  46.38 
 
 
156 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  33.11 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  39.77 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  41.67 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  34.01 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  35.34 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  32.48 
 
 
122 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  25.37 
 
 
175 aa  62  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  40.74 
 
 
138 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  32 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  31.79 
 
 
188 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  33.33 
 
 
154 aa  57.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  32.84 
 
 
158 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  29.33 
 
 
300 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  29.85 
 
 
156 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  28.79 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  28.35 
 
 
163 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  31.65 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  32.86 
 
 
186 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  38.46 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  29.56 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  29.66 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  34.57 
 
 
163 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  42.19 
 
 
146 aa  44.3  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  31.39 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  26.47 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  31.71 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  30.2 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1152  hypothetical protein  30.25 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1591  hypothetical protein  27.93 
 
 
146 aa  43.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  29.79 
 
 
149 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>