45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2922 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  280  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  42.19 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  45.45 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  46.02 
 
 		 146 aa  92.8  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  31.39 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  40.31 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  34.21 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  34.03 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  34.62 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  33.82 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  34.09 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  34.09 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  35.25 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  35.77 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  35.77 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  41.9 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  34.53 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  37.5 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  29.84 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  29.29 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  41.98 
 
 		 187 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  41.23 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  39.51 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  31.68 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  26.92 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  31.45 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  30.85 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  31.48 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  28.79 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  25 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  29.6 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  28 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  31.96 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  31 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  30.68 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  30.68 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  23.36 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  28.08 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  32.98 
 
 		 163 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  31.36 
 
 		 166 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  27.2 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  25.74 
 
 		 165 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>