44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2577 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  69.94 
 
 
188 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  68.71 
 
 
188 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  73.55 
 
 
163 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  60.4 
 
 
163 aa  184  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  59.09 
 
 
156 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  58.39 
 
 
166 aa  167  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  60.4 
 
 
165 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  58.82 
 
 
156 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  55.35 
 
 
163 aa  161  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  57.05 
 
 
156 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  64.22 
 
 
124 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  134  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  51.94 
 
 
158 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  47.02 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  47.48 
 
 
161 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  51.08 
 
 
163 aa  117  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  51.23 
 
 
167 aa  115  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  46.67 
 
 
185 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  49.66 
 
 
186 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  45.54 
 
 
154 aa  97.4  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  36.15 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  38.06 
 
 
156 aa  84.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  37.01 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  31.51 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  30.67 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  43.59 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  33.09 
 
 
151 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  26.15 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  34.09 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  32.91 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  36.75 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  30.4 
 
 
122 aa  51.2  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  27.7 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  27.03 
 
 
152 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  36.25 
 
 
138 aa  47  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  27.21 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  30.28 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  36.25 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  40.74 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  27.94 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>