45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4185 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  45.27 
 
 
152 aa  130  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  43.42 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  46.43 
 
 
157 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  41.43 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  44.03 
 
 
165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  49.3 
 
 
164 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  44.35 
 
 
122 aa  89.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  42.45 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  45.77 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  56.79 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  36.3 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  39.81 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  35.46 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  37.29 
 
 
185 aa  70.9  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  30.77 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  32.08 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  31.69 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  34.06 
 
 
188 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  34.78 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  42.11 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  34.06 
 
 
188 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  31.78 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  57.8  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  28.78 
 
 
163 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  34.15 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  35.09 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  32.33 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  35.88 
 
 
186 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  31.46 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  30.6 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  35.87 
 
 
124 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  27.82 
 
 
163 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  32.1 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  29.51 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  34.15 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  35.87 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  36.25 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  35.16 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  28.89 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  28.57 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>