29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1541 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  290  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  46.36 
 
 
155 aa  120  7e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  37.32 
 
 
146 aa  87.4  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  37.59 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  37.96 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  45.65 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  43.68 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  32.35 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  35.71 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  35.81 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  30.43 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  35.61 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  34.06 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  40.69 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  33.06 
 
 
151 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  31.9 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  34.01 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  35.92 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  30.92 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  37.35 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  33.33 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  34.88 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  35.25 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0310  hypothetical protein  34.15 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0296  hypothetical protein  34.15 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  29.41 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>