40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18211 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  73.04 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  65.54 
 
 
170 aa  167  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  42.2 
 
 
155 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  42.59 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  42.59 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  41.44 
 
 
152 aa  87  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  45.35 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  51.25 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  55.56 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  32.33 
 
 
155 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  37.8 
 
 
146 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  44.44 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  34.95 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  33.06 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  40.91 
 
 
160 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  41.25 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  34.94 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  35.71 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  34.48 
 
 
188 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  34.06 
 
 
188 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  31.82 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  27.03 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  40.26 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  34.78 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  35.16 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  32.73 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  43.59 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  32.73 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  34.07 
 
 
185 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  30.95 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  39.24 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1152  hypothetical protein  28.85 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  29.47 
 
 
149 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  41.03 
 
 
186 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  33.64 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  32.43 
 
 
165 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1128  hypothetical protein  32.05 
 
 
300 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.163819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  33.64 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>