46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1751 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  367  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  47.65 
 
 
162 aa  141  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  45.59 
 
 
145 aa  124  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  51.49 
 
 
161 aa  121  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  44.6 
 
 
163 aa  121  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  46.04 
 
 
156 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  41.91 
 
 
163 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  52.86 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  37.91 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  40 
 
 
188 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  46.11 
 
 
163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  40.91 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  48.06 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  42.57 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  47.45 
 
 
156 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  44.53 
 
 
156 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  38.62 
 
 
175 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  38.16 
 
 
165 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  50.37 
 
 
167 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  46.67 
 
 
170 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  44.85 
 
 
163 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  40.62 
 
 
124 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  35.56 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  40 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  40.78 
 
 
146 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  29.01 
 
 
149 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  36.26 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  29.61 
 
 
152 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  44.3 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  38.1 
 
 
160 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  29.56 
 
 
155 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  41.25 
 
 
122 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  37.29 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  39.74 
 
 
154 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  39.29 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  26.87 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  30.71 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  31.01 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  32.47 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  28.78 
 
 
148 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  34.07 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  28.48 
 
 
150 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>