39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1431 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  303  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  44.06 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  46.04 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  44.36 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  34.11 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  36.09 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  35.33 
 
 
161 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  35.16 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  36.3 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  31.58 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  34.72 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  33.79 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  38.56 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  38.06 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  37.82 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  38.35 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  37.98 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  34.38 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  36.49 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  36.5 
 
 
167 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  36.23 
 
 
154 aa  60.5  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  31.78 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  29.41 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  28.99 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  28.99 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  27.89 
 
 
152 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  28.68 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  28.68 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  38.46 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  32.58 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  32.69 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  31.46 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1457  hypothetical protein  30.54 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>