41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1310 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  61.64 
 
 		 163 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  69.5 
 
 		 166 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  70.92 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  67.81 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  60 
 
 		 188 aa  167  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  58.71 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  66.2 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  59.31 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  55.35 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  60.42 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  46.9 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  45.89 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  48.99 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  50.98 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  59.6 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  68.47 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  46.81 
 
 		 175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  50.68 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  41.91 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  43.87 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  38.64 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  38.26 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  34.11 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  35.1 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  30.07 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  32.33 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  32.56 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  30.37 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  27.05 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  28.37 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  37.18 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  37.04 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  22.9 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  29.07 
 
 		 146 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  29.21 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  31.17 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>