36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1644 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  38.24 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  38.26 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  40.54 
 
 		 188 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  38 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  40.54 
 
 		 188 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  37.16 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  40 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  45.45 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  37.29 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  42.48 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  31.76 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  41.53 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  34.67 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  36.13 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  33.85 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  36.59 
 
 		 186 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  39.6 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  31.11 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  31.34 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  43.1 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  28.99 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  27.81 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  23.88 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  28.68 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  27.91 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  29.93 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  24.79 
 
 		 122 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  24.67 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>