37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0414 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  308  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4460  hypothetical protein  70.47 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  50.68 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1310  hypothetical protein  48.99 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  47.65 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  49.35 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3686  hypothetical protein  54.55 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  51.13 
 
 		 145 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6886  hypothetical protein  46.76 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5495  hypothetical protein  48.2 
 
 		 188 aa  124  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.298573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2369  hypothetical protein  48.92 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0115566 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1160  hypothetical protein  49.3 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.541838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3318  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  38.89 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2577  hypothetical protein  47.48 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  46.76 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  44.76 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5911  hypothetical protein  47.48 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1574  hypothetical protein  51.43 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00494576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3418  hypothetical protein  49.07 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1431  hypothetical protein  35.33 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3270  hypothetical protein  38.13 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.660762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1345  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.77021 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1644  hypothetical protein  30.88 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  31.82 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  33.11 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  26.45 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  28.77 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  29.55 
 
 		 146 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  28.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  28.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  31.11 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  28.68 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  34.18 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  28.04 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>