36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1353 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  259  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  58.7 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2315  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0611704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2971  hypothetical protein  48.03 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0997  membrane protein  38.02 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4229  membrane protein  37.72 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1487  membrane protein  36.36 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187632  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0612  hypothetical protein  33.05 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2327  hypothetical protein  36.22 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  30.53 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1541  hypothetical protein  32.35 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.226032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1232  hypothetical protein  33.08 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0711064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4545  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2922  hypothetical protein  42.19 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.389384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4723  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1398  hypothetical protein  31.3 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1432  hypothetical protein  31.3 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000937611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4921  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0141  hypothetical protein  40.62 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2707  hypothetical protein  32.79 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0996  hypothetical protein  31.4 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.686278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  34.94 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4185  hypothetical protein  32.08 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1748  hypothetical protein  34.35 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1751  hypothetical protein  26.87 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0690  hypothetical protein  37.66 
 
 		 175 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7799  hypothetical protein  26.92 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.446366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3389  hypothetical protein  27.91 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.38579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1152  hypothetical protein  35.63 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0414  hypothetical protein  34.18 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.697482  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3315  hypothetical protein  29.46 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.280631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1411  hypothetical protein  24.24 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2306  hypothetical protein  29.46 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.470065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0616  hypothetical protein  28.68 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.424695 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>