19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1152 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1152  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  277  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1863  hypothetical protein  41.5 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1226  hypothetical protein  37.21 
 
 
151 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0310  hypothetical protein  30.22 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0296  hypothetical protein  30.22 
 
 
143 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1165  transport system permease protein  32.03 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.298674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1353  hypothetical protein  35.63 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1719  hypothetical protein  34.18 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0405538  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5101  hypothetical protein  31.78 
 
 
175 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.307811 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  35.14 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18211  hypothetical protein  28.85 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  30.91 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1896  hypothetical protein  29.29 
 
 
146 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1995  hypothetical protein  29.49 
 
 
148 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  27.41 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1489  hypothetical protein  34.18 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  38.16 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  38.16 
 
 
161 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1365  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>