34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4994 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  100 
 
 		 303 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  63.7 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  61.39 
 
 		 304 aa  385  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  42.39 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  43.09 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  33.93 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  32.55 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  32.94 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  31.06 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  34.55 
 
 		 368 aa  169  7e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  31.8 
 
 		 358 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  31.29 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  32.11 
 
 		 316 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  28.88 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  29.38 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  26.3 
 
 		 330 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  28.72 
 
 		 285 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  31.96 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  24.38 
 
 		 315 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  32.07 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  45.19 
 
 		 118 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  25.76 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  23.78 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  25.32 
 
 		 360 aa  90.5  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  25.44 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.67 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  24.86 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  17.98 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  20.94 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  22.58 
 
 		 301 aa  49.3  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1519  Abi family protein  22.67 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198725 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0427  Abi family protein  23.85 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000079529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0416  Abi family protein  23.85 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000655529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0357  4-aminobutyrate aminotransferase  26.11 
 
 		 478 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>