32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2514 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  100 
 
 
304 aa  629  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  75.25 
 
 
303 aa  485  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  61.39 
 
 
303 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  36.36 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  39.14 
 
 
318 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  33.11 
 
 
299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  32.34 
 
 
342 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.73 
 
 
368 aa  160  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  29.81 
 
 
315 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  29.73 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  30.03 
 
 
322 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  29.84 
 
 
358 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  30 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.71 
 
 
293 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  29.93 
 
 
316 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  27.86 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  30.89 
 
 
285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  25.83 
 
 
330 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  24.75 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  42.72 
 
 
118 aa  89.7  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  29.84 
 
 
202 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  25.23 
 
 
315 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  25.61 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.44 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  25.38 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.48 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.89 
 
 
326 aa  77  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1519  Abi family protein  27.56 
 
 
321 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198725 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  24.77 
 
 
301 aa  55.8  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2471  hypothetical protein  27.68 
 
 
148 aa  49.7  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179493  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  23.45 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  18.43 
 
 
289 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>