29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2861 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  100 
 
 
322 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  43.52 
 
 
321 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  35.05 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  33.96 
 
 
318 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  33.33 
 
 
310 aa  165  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  32.1 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  31.08 
 
 
304 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.33 
 
 
368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  28.32 
 
 
342 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  30.56 
 
 
315 aa  143  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  28.74 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  30.03 
 
 
304 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  30.34 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  28.88 
 
 
303 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  31.56 
 
 
358 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  30.36 
 
 
285 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  29.1 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  24.56 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  38.05 
 
 
118 aa  87.8  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.45 
 
 
326 aa  87  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  23.47 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  23.94 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  27.23 
 
 
202 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.29 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  23.11 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  22.81 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  22.06 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  22.85 
 
 
339 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1019  Abi family protein  19.8 
 
 
332 aa  43.1  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>