28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3524 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  100 
 
 
310 aa  645    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  35.91 
 
 
342 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  35.44 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  33.23 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  34.38 
 
 
304 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  33.33 
 
 
322 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  33.13 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  34.08 
 
 
299 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  33.65 
 
 
318 aa  155  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.84 
 
 
321 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  31.29 
 
 
303 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  31.6 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  30.35 
 
 
303 aa  127  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  30 
 
 
304 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  29.81 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  25.93 
 
 
323 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  27.54 
 
 
317 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  30.93 
 
 
293 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  27.06 
 
 
330 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  27.82 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  27.46 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  25.41 
 
 
360 aa  85.9  8e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.86 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  42.31 
 
 
118 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  29.35 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.62 
 
 
319 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  22.27 
 
 
289 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.28 
 
 
339 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>