30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1061 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  100 
 
 
304 aa  638    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  47.54 
 
 
318 aa  295  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  42.39 
 
 
303 aa  261  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  39.48 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  36.36 
 
 
304 aa  202  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  37.38 
 
 
315 aa  196  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  36.31 
 
 
342 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  31.64 
 
 
336 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.72 
 
 
368 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  35.18 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  34.38 
 
 
310 aa  172  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  31.08 
 
 
322 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  29.57 
 
 
321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  29.74 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  30.72 
 
 
316 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  25.98 
 
 
315 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  47.12 
 
 
118 aa  100  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.32 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  25.17 
 
 
323 aa  94  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  27.27 
 
 
326 aa  92.4  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  25.85 
 
 
285 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  24.89 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  23.56 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  26.35 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.53 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  27.6 
 
 
202 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.24 
 
 
339 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  23.56 
 
 
289 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2471  hypothetical protein  37.37 
 
 
148 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  21.76 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>