29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1154 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  100 
 
 
318 aa  660    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  47.54 
 
 
304 aa  295  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  43.09 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  43.52 
 
 
303 aa  228  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  39.14 
 
 
304 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  38.08 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  34.11 
 
 
342 aa  189  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  35.35 
 
 
368 aa  186  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  33.96 
 
 
322 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  32.54 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  32.4 
 
 
321 aa  156  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  33.65 
 
 
310 aa  155  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  33.75 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  31.13 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  29.82 
 
 
293 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  23.92 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  45.87 
 
 
118 aa  94.4  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  25.74 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  24.77 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  26.4 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  29.12 
 
 
202 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  21.56 
 
 
319 aa  75.9  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  20.49 
 
 
326 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  23.91 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  24.07 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  20.36 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  22.55 
 
 
339 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  24.29 
 
 
276 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>