28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1806 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  100 
 
 
321 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  43.52 
 
 
322 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  32.4 
 
 
316 aa  164  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  32.4 
 
 
318 aa  156  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  32.84 
 
 
310 aa  155  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  31.76 
 
 
368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  29.57 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  32.18 
 
 
299 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  28.74 
 
 
342 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  27.08 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  29.38 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  25.51 
 
 
336 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  28.4 
 
 
303 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  27.69 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  30.08 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  27.54 
 
 
358 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  25.81 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.9 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.76 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  39.66 
 
 
118 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  22.35 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  27.78 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  27.75 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  24.77 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  24.19 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  25.12 
 
 
202 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  26.43 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  21 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>