34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0357 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  100 
 
 
303 aa  629  1e-179  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  75.25 
 
 
304 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  63.7 
 
 
303 aa  402  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  39.48 
 
 
304 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  43.52 
 
 
318 aa  228  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  34.23 
 
 
299 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  31.56 
 
 
315 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  32.85 
 
 
342 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  34.35 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  31.72 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  29.64 
 
 
358 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  30.34 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  30.35 
 
 
310 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  28.4 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  30.13 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  34.4 
 
 
293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  31.56 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  26.75 
 
 
330 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  28.33 
 
 
319 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  29.02 
 
 
202 aa  90.1  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  42.31 
 
 
118 aa  87.4  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  26.36 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  24.3 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  24.16 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  22.22 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.57 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.56 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  23.39 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1519  Abi family protein  29.19 
 
 
321 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198725 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2471  hypothetical protein  30.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179493  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  25.68 
 
 
276 aa  53.1  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  22.69 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0427  Abi family protein  25.21 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000079529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0416  Abi family protein  25.21 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000655529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>