31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1138 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  100 
 
 
319 aa  650    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  27.44 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  30.33 
 
 
360 aa  101  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  28.33 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  23.78 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  27.31 
 
 
293 aa  85.9  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.9 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  28.38 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  25.44 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  21.56 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  23.27 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  25.53 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  25.62 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  24.29 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  24.24 
 
 
299 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1019  Abi family protein  28.5 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  24.03 
 
 
336 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  25.52 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.81 
 
 
326 aa  60.1  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  24.58 
 
 
285 aa  60.1  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  24.14 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  27.73 
 
 
276 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  22.75 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  24.73 
 
 
202 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  27.83 
 
 
289 aa  57.4  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  21.55 
 
 
323 aa  56.6  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  22.99 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.19 
 
 
339 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  22.91 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  31.58 
 
 
118 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0622  hypothetical protein  26.82 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000539808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>