27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  100 
 
 		 293 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  34.4 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  32.71 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  29.82 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  31.96 
 
 		 303 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  29.82 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  30.93 
 
 		 310 aa  99  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  30.08 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  26.32 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  29.1 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  28.46 
 
 		 336 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  28.81 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  28.63 
 
 		 315 aa  87  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  27.31 
 
 		 319 aa  85.9  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  24.2 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  28.85 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  25.1 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  27.21 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  24.37 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  24.03 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  24.03 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  25.5 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  35.05 
 
 		 118 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  22.12 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  25.44 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  21.83 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.76 
 
 		 339 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>