18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0071 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0427  Abi family protein  41.99 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000079529  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0416  Abi family protein  41.99 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000655529  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  39.53 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1519  Abi family protein  31.79 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198725 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0416  Abi-like protein  29.5 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.35712 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0622  hypothetical protein  30.04 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000539808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  29.05 
 
 		 202 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  24.29 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  24.77 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  22.69 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  22.58 
 
 		 303 aa  49.3  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  24.89 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  22.91 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  21.76 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  20.1 
 
 		 358 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.23 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>