28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4054 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  100 
 
 
315 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  37.3 
 
 
330 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  40.43 
 
 
202 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  24.69 
 
 
303 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  24.77 
 
 
315 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  25.65 
 
 
368 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  26.28 
 
 
304 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  23.68 
 
 
358 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  27.8 
 
 
310 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  24.3 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  26.07 
 
 
299 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  26.4 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  25.54 
 
 
304 aa  89  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  26.81 
 
 
285 aa  89  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  27.92 
 
 
342 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  23.94 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.77 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  26.23 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  23.48 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0048  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.34 
 
 
339 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000156984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  26.75 
 
 
293 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  23.64 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  26.51 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  24.47 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  24.03 
 
 
289 aa  50.8  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  22.61 
 
 
323 aa  49.3  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  23.12 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  28.57 
 
 
118 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>