26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0426 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0426  Abi-like protein  100 
 
 		 118 aa  245  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  45.19 
 
 		 303 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1061  phage AbiD protein  47.12 
 
 		 304 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1154  Abi family protein  45.87 
 
 		 318 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.554725  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  41.07 
 
 		 315 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  42.59 
 
 		 299 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2861  Abi family protein  38.05 
 
 		 322 aa  87.8  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  42.31 
 
 		 303 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  43.75 
 
 		 342 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1806  abortive infection bacteriophage resistance protein  39.66 
 
 		 321 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  42.72 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0031  Abi-like  34.95 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3524  Abi family protein  42.31 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4012  Abi family protein  40 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.628859  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5272  Abi family protein  33.66 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246639 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02065  abortive infection bacteriophage resistance protein  33.01 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34500  abortive infection bacteriophage resistance protein  35.05 
 
 		 293 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10172  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0605  hypothetical protein  33.98 
 
 		 323 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.203286  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3652  Abi family protein  33.94 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0432  Abi-like protein  33.33 
 
 		 360 aa  57.4  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0400  Abi-like protein  30.61 
 
 		 202 aa  57  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1698  abortive infection bacteriophage resistance protein  37 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00541232  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4682  Abi family protein  28.97 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  32.67 
 
 		 317 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4054  Abi family protein  29.21 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1138  abortive infection bacteriophage resistance protein  31.58 
 
 		 319 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000644215  hitchhiker  0.00199936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>