15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1519 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1519  Abi family protein  100 
 
 
321 aa  662    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.198725 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0416  Abi-like protein  36.16 
 
 
337 aa  199  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.35712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0071  hypothetical protein  31.79 
 
 
301 aa  151  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.735116  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0052  hypothetical protein  35.71 
 
 
276 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0416  Abi family protein  30.31 
 
 
324 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000655529  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0427  Abi family protein  30.31 
 
 
324 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000079529  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0622  hypothetical protein  28.38 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000539808  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0357  Abi-like  29.19 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.949263  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1229  Abi family protein  23.95 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0049  hypothetical protein  24.22 
 
 
299 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.23873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4658  Abi family protein  24.6 
 
 
317 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2514  Abi-like protein  27.56 
 
 
304 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4994  Abi family protein  22.67 
 
 
303 aa  46.6  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00172  Abi-like protein  34.34 
 
 
342 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3671  hypothetical protein  23.83 
 
 
315 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>