More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2653 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2653  Serine acetyltransferase-like protein  100 
 
 
176 aa  350  5.9999999999999994e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  34.71 
 
 
170 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  32.48 
 
 
178 aa  87  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  41.12 
 
 
260 aa  85.1  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4948  serine acetyltransferase  33.1 
 
 
146 aa  84.7  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0967184  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  43.81 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.99 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  36.07 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.97 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  40.15 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  39.64 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  34.76 
 
 
163 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  38.05 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.73 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  37.17 
 
 
268 aa  77.8  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  38.74 
 
 
194 aa  77.4  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  41.44 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  35.54 
 
 
191 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  39.82 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  28.57 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12330  serine O-acetyltransferase  35.77 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.369059  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  33.14 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  38.74 
 
 
255 aa  74.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0718  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.052747  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  38.14 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0082  serine O-acetyltransferase  40.95 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0605455  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  31.85 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1389  serine O-acetyltransferase  35.66 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.0958041 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  42.27 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  36.8 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  39.81 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4324  Serine O-acetyltransferase  30.56 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  39.62 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  36.79 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  39.62 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  37.63 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  36.19 
 
 
263 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.17 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  36.19 
 
 
263 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  32.1 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5090  Serine acetyltransferase-like  31.52 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  36.07 
 
 
248 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  39.6 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  32.1 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  30.86 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  39.45 
 
 
181 aa  70.9  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  39.05 
 
 
247 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  34.06 
 
 
258 aa  70.9  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  34.06 
 
 
258 aa  70.9  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  35.71 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0177  serine O-acetyltransferase  40.19 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.635275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  32.1 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  38.74 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1149  Serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268491  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  38.53 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.3 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  36.45 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1110  Serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.749928  normal  0.160991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  36.97 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  35.14 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  38.89 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  37.82 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  43.12 
 
 
314 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  34.21 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  36.52 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  36.76 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1080  serine O-acetyltransferase  37.07 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0884216  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1290  serine O-acetyltransferase  30.88 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0302929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  35.51 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  38.24 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  37.14 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  37.04 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  40.59 
 
 
271 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  36.28 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  35.78 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  32.16 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.84 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  37.61 
 
 
262 aa  68.2  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  36.19 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12359  serine acetyltransferase cysE  36.54 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  39.53 
 
 
539 aa  67.8  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  36.11 
 
 
273 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
215 aa  67.8  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4354  hypothetical protein  38.46 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.372649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 
273 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4294  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.46 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  36.27 
 
 
264 aa  67.8  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  36.27 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 
273 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 
273 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2211  serine O-acetyltransferase  41.07 
 
 
327 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  36.19 
 
 
257 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>