More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3942 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  61.18 
 
 		 191 aa  204  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  36.53 
 
 		 177 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.83 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  38.79 
 
 		 170 aa  105  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  33.15 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  32.93 
 
 		 177 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  30.7 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  30.7 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  35.54 
 
 		 180 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  37.09 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  37.09 
 
 		 268 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.86 
 
 		 173 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  33.13 
 
 		 174 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  32.74 
 
 		 173 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  33.13 
 
 		 174 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  32.63 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  32.12 
 
 		 174 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  30.36 
 
 		 172 aa  88.6  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 		 191 aa  88.2  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  32.52 
 
 		 174 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  33.15 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  34.42 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  34.67 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.57 
 
 		 174 aa  88.2  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  36.91 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0718  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.052747  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  35.1 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  33.9 
 
 		 273 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 280 aa  85.9  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  29.67 
 
 		 280 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 		 273 aa  85.5  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  32.95 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 		 280 aa  85.5  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  32.95 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  32.18 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  34.64 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  30.06 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  32.95 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0082  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0605455  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  34.64 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  31.03 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  34.25 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  32.95 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  34.64 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.89 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  32.9 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  35.81 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  32.43 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  34 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  35.06 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.49 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0151  serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20921  Serine acetyltransferase  32.95 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.869506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  29.14 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  30.73 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  31.02 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  34.67 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  28.57 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  30 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2097  serine O-acetyltransferase  27.96 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  34.19 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  37.97 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  34.19 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  28.57 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  28.9 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  30.64 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3564  serine O-acetyltransferase  29.89 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3953  Serine O-acetyltransferase  34 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0171272  hitchhiker  0.00273394 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  33.99 
 
 		 273 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1097  serine O-acetyltransferase  31.72 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.486928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1003  serine O-acetyltransferase  31.72 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169467  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  31.79 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2551  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  29.31 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  33.55 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1438  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  34.87 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  31.87 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1662  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2165  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  34.87 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2686  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3151  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  29.07 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  30.23 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1936  serine O-acetyltransferase  32.76 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0874161  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  34.73 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2602  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  31.1 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>