More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1006 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  350  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  73.1 
 
 
174 aa  264  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  72.67 
 
 
174 aa  263  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  72.09 
 
 
174 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  69.77 
 
 
174 aa  256  9e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  65.29 
 
 
173 aa  243  8e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  62.79 
 
 
174 aa  229  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  61.76 
 
 
172 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  64.85 
 
 
170 aa  214  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  47.67 
 
 
177 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  41.24 
 
 
184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 
175 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09440  serine O-acetyltransferase  38.86 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.33324  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.75 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  42.25 
 
 
228 aa  111  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  37.23 
 
 
280 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  38.95 
 
 
221 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  43.24 
 
 
222 aa  107  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  37.8 
 
 
224 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  37.8 
 
 
223 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  39.34 
 
 
275 aa  107  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  37.14 
 
 
169 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  39.77 
 
 
194 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  36.96 
 
 
226 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  38.51 
 
 
260 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  37.8 
 
 
221 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 
221 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 
221 aa  105  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  41.67 
 
 
252 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 
217 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  41.45 
 
 
215 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  36.57 
 
 
169 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
268 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  33.87 
 
 
230 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  38.18 
 
 
180 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  41.55 
 
 
240 aa  102  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  36.87 
 
 
220 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
214 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  44.83 
 
 
194 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
221 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  36.84 
 
 
237 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  35.76 
 
 
225 aa  100  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0083  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
221 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  38.3 
 
 
248 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  38.85 
 
 
262 aa  100  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  36.7 
 
 
250 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12330  serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
195 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.369059  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
191 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  37.64 
 
 
242 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  37.08 
 
 
261 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  32.96 
 
 
280 aa  99.4  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  36.47 
 
 
254 aa  99.8  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  37.08 
 
 
261 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  36.78 
 
 
229 aa  99  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0465  Serine O-acetyltransferase  35.09 
 
 
221 aa  99  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
175 aa  99  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  34.38 
 
 
273 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  39.44 
 
 
239 aa  98.6  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
245 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
245 aa  98.2  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  36.52 
 
 
261 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  43.2 
 
 
191 aa  97.8  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  41.55 
 
 
242 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  39.85 
 
 
225 aa  97.8  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  34.29 
 
 
267 aa  97.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1389  serine O-acetyltransferase  34.81 
 
 
194 aa  97.4  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.0958041 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  33.75 
 
 
273 aa  97.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  32.96 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  36.53 
 
 
258 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  35.96 
 
 
261 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  36.26 
 
 
203 aa  97.1  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  33.75 
 
 
273 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  33.75 
 
 
273 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  35.98 
 
 
225 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 
223 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  37.57 
 
 
238 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  36.21 
 
 
249 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3701  serine O-acetyltransferase  41.55 
 
 
252 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 
260 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  32.4 
 
 
222 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  35.59 
 
 
258 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  51.92 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  35.93 
 
 
258 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  41.55 
 
 
255 aa  95.5  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  38.36 
 
 
191 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  38.01 
 
 
194 aa  95.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  37.59 
 
 
258 aa  95.1  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  35.14 
 
 
265 aa  95.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  34.78 
 
 
273 aa  94.7  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0854  serine acetyltransferase  39.87 
 
 
212 aa  94.7  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.385775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  39.33 
 
 
222 aa  94.7  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0784  serine acetyltransferase  39.87 
 
 
212 aa  94.7  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000104078  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  32.16 
 
 
273 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
233 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>