More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3136 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  98.85 
 
 		 174 aa  341  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  95.98 
 
 		 174 aa  334  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  89.29 
 
 		 174 aa  307  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  72.67 
 
 		 173 aa  263  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  67.06 
 
 		 173 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  67.28 
 
 		 174 aa  236  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  66.07 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  59.76 
 
 		 170 aa  203  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  48.5 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  40.67 
 
 		 184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  42.55 
 
 		 228 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.26 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  38.95 
 
 		 275 aa  97.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  41.38 
 
 		 191 aa  95.9  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  37.67 
 
 		 215 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  42 
 
 		 250 aa  95.1  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 		 280 aa  94.7  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  35.71 
 
 		 180 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  40.41 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.96 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12330  serine O-acetyltransferase  38.01 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.369059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  39.1 
 
 		 225 aa  92.4  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  49.53 
 
 		 175 aa  92.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  38.51 
 
 		 223 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  38.89 
 
 		 262 aa  91.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 		 221 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  39.73 
 
 		 169 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09440  serine O-acetyltransferase  35.26 
 
 		 195 aa  90.9  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.33324  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  36.59 
 
 		 221 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  42.86 
 
 		 217 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 		 248 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  40.38 
 
 		 253 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 239 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  35.33 
 
 		 218 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  34.9 
 
 		 280 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 		 242 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 		 252 aa  89.4  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  35.33 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  38.78 
 
 		 309 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  41.72 
 
 		 220 aa  89  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  40.41 
 
 		 203 aa  89  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  39.1 
 
 		 302 aa  88.6  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  34.76 
 
 		 163 aa  88.6  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0747  serine O-acetyltransferase  38.51 
 
 		 201 aa  88.2  5e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.075865  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 260 aa  88.2  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  32.52 
 
 		 238 aa  88.2  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.426146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  37.82 
 
 		 240 aa  88.2  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.4 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  35.93 
 
 		 261 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.4 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  33.73 
 
 		 178 aa  87.8  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.4 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  33.93 
 
 		 191 aa  87.8  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  35.93 
 
 		 261 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  40.69 
 
 		 176 aa  87.4  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 		 221 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 		 221 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  34.9 
 
 		 273 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1290  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 		 237 aa  87.4  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0302929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  35.66 
 
 		 273 aa  87  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  39.46 
 
 		 222 aa  87  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.4 
 
 		 162 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  38.16 
 
 		 253 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  38.46 
 
 		 256 aa  87  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 		 261 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  32.41 
 
 		 273 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  35.66 
 
 		 273 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  34.76 
 
 		 268 aa  86.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  34.76 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 		 176 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 		 261 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  35.59 
 
 		 226 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  39.83 
 
 		 194 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  35.66 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  36.73 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  40.69 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  39.32 
 
 		 194 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  36.73 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  35.66 
 
 		 273 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  34.76 
 
 		 223 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  32.41 
 
 		 273 aa  85.5  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  37.82 
 
 		 234 aa  85.5  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>