More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4091 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  100 
 
 
178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  52.38 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3271  satase isoform II  40.36 
 
 
174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3549  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  38.71 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  36.65 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  39.19 
 
 
166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.36 
 
 
176 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  35.4 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  35.4 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  33.74 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  34.36 
 
 
176 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3267  serine O-acetyltransferase  36.88 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.37 
 
 
163 aa  97.4  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  34.15 
 
 
162 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  33.54 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  32.93 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  32.93 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  32.93 
 
 
162 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  45.87 
 
 
240 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.1 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  33.53 
 
 
174 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  30.86 
 
 
170 aa  88.6  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.64 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  33.73 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  33.73 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  33.73 
 
 
174 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  34.75 
 
 
173 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  34.93 
 
 
245 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  34.67 
 
 
229 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  34.93 
 
 
245 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2340  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  38.21 
 
 
146 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.68727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.74 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  34.48 
 
 
172 aa  85.1  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  30.06 
 
 
238 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  42.61 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  38.35 
 
 
240 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  39.81 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  32.04 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4948  serine acetyltransferase  34.56 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0967184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  37.67 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  34.04 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  33.79 
 
 
309 aa  82.4  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  40.58 
 
 
223 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  39.84 
 
 
226 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1882  serine O-acetyltransferase  41.23 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  0.794876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  37.98 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0457  transferase hexapeptide, putative  36.55 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000034656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
248 aa  81.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6012  putative hexapeptide transferase family protein  35.42 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493512  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  33.8 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0115  hexapeptide transferase family protein  34.93 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000250738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  39.13 
 
 
238 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4978  serine O-acetyltransferase (serine acetyltransferase)  32.2 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  37.8 
 
 
302 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  38.67 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  38.03 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  32.7 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2653  Serine acetyltransferase-like protein  32.48 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  38.54 
 
 
539 aa  79  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4354  hypothetical protein  34.46 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.372649 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  40.91 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4294  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.46 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  41.28 
 
 
242 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2247  putative hexapeptide transferase family protein  36.3 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.878495  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  33.1 
 
 
256 aa  77.8  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  33.79 
 
 
253 aa  77.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  35.17 
 
 
239 aa  77.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  33.57 
 
 
258 aa  77.8  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  32.61 
 
 
268 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  32.61 
 
 
268 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  45.1 
 
 
158 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0718  serine O-acetyltransferase  37.82 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.052747  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0082  serine O-acetyltransferase  41.07 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0605455  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  37.74 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  36.21 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0840  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  39.02 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  32.59 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  29.86 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  37.06 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  38.74 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20921  Serine acetyltransferase  35.43 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.869506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  31.45 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  31.15 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  29.03 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  31.45 
 
 
253 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  33.85 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  31.15 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  30.92 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  34.96 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>