More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5910 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
176 aa  348  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  98.3 
 
 
176 aa  343  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  90.86 
 
 
176 aa  325  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  71.59 
 
 
178 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  71.59 
 
 
178 aa  266  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  71.26 
 
 
176 aa  263  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3267  serine O-acetyltransferase  72.3 
 
 
150 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3271  satase isoform II  58.96 
 
 
174 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.3 
 
 
182 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  34.36 
 
 
178 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3549  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  35.57 
 
 
166 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  36.91 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  44.44 
 
 
260 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.89 
 
 
163 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  44.68 
 
 
280 aa  103  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  48.61 
 
 
169 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  46.94 
 
 
264 aa  101  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  47.92 
 
 
169 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  47.26 
 
 
249 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  43.66 
 
 
240 aa  100  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  38.36 
 
 
162 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  38.36 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  38.36 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  38.36 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.74 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  40.76 
 
 
271 aa  99  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3953  Serine O-acetyltransferase  44.44 
 
 
250 aa  98.6  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0171272  hitchhiker  0.00273394 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 
275 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  42.95 
 
 
280 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  42.86 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2340  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.31 
 
 
146 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.68727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.04 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0718  serine O-acetyltransferase  37.13 
 
 
183 aa  95.1  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.052747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 
248 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  43.84 
 
 
250 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  41.96 
 
 
239 aa  94.4  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3701  serine O-acetyltransferase  41.96 
 
 
252 aa  94  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.67 
 
 
173 aa  94  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  39.04 
 
 
172 aa  94  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2139  serine O-acetyltransferase  43.36 
 
 
259 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0969839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  41.22 
 
 
228 aa  93.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3035  serine O-acetyltransferase  44.06 
 
 
261 aa  93.6  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.718  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  39.66 
 
 
268 aa  93.6  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  43.36 
 
 
256 aa  94  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  43.8 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  42.11 
 
 
262 aa  92.8  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0082  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  92  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0605455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  41.1 
 
 
242 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
242 aa  91.7  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
273 aa  91.3  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4791  serine O-acetyltransferase  39.87 
 
 
213 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312597  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  40.14 
 
 
274 aa  90.1  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 
226 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  44.76 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  42.66 
 
 
253 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  37.34 
 
 
258 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
309 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  39.66 
 
 
238 aa  89.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  36.93 
 
 
263 aa  89  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  40.85 
 
 
240 aa  89.4  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  35.75 
 
 
222 aa  89  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  36.93 
 
 
263 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  43.71 
 
 
259 aa  89.4  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  48.18 
 
 
175 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  41.96 
 
 
261 aa  88.2  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  38.73 
 
 
273 aa  88.2  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.88 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  40.56 
 
 
222 aa  88.2  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 
273 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 
273 aa  88.2  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  40.69 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 
221 aa  87.8  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  44.17 
 
 
176 aa  87.8  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  45.3 
 
 
259 aa  87.8  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  38.73 
 
 
273 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  40.69 
 
 
174 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  41.26 
 
 
249 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
302 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  42.73 
 
 
223 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  38.57 
 
 
273 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  38.62 
 
 
263 aa  86.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  45.08 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  44.04 
 
 
273 aa  86.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  42.75 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  36.21 
 
 
169 aa  86.7  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  48.67 
 
 
255 aa  86.3  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  44.72 
 
 
253 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  49.12 
 
 
256 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  46.85 
 
 
265 aa  86.3  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>