More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4046 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
182 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  52.38 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3271  satase isoform II  44.44 
 
 
174 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  44.87 
 
 
176 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  44.94 
 
 
176 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  44.3 
 
 
176 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  38.46 
 
 
178 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  40.26 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  41.29 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3267  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 
150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3549  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  40.67 
 
 
166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  40.67 
 
 
166 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  37.27 
 
 
162 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.65 
 
 
162 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.65 
 
 
162 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.65 
 
 
162 aa  104  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.02 
 
 
162 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2340  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  46.15 
 
 
146 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.68727 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.4 
 
 
162 aa  101  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  34.16 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  36.78 
 
 
172 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.27 
 
 
174 aa  97.1  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  36.72 
 
 
176 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  34.71 
 
 
170 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  30.65 
 
 
184 aa  92  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.95 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  39.22 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  34.52 
 
 
163 aa  89  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0840  serine O-acetyltransferase  40.16 
 
 
167 aa  89  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  35.03 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0561  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.96 
 
 
204 aa  86.3  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.740999  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  32.4 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  32.53 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  28.49 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.13 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  29.78 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  33.53 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  36.59 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  36.59 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  34.15 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  34.15 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  34.84 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  30.06 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  37.4 
 
 
274 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  33.74 
 
 
174 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  35.77 
 
 
265 aa  81.6  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  34.32 
 
 
164 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  33.95 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  30.6 
 
 
253 aa  80.9  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  36.59 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  36.75 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  34.67 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1757  serine O-acetyltransferase  40.19 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  37.29 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  35.77 
 
 
260 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6012  putative hexapeptide transferase family protein  35.86 
 
 
139 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493512  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  36.75 
 
 
259 aa  79  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  35.66 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  34.35 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
256 aa  78.2  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1690  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.52 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0534677  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4354  hypothetical protein  41.9 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.372649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4294  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.9 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  34.13 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  36.28 
 
 
258 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  31.4 
 
 
249 aa  77.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  35.9 
 
 
259 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  36.61 
 
 
275 aa  77.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  31.4 
 
 
264 aa  77.8  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  33.79 
 
 
191 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  30.92 
 
 
253 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  29.21 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
257 aa  77  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  30.81 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  34.88 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 
268 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4791  serine O-acetyltransferase  33.55 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312597  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  35.54 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  30 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  31.13 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3953  Serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0171272  hitchhiker  0.00273394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1882  serine O-acetyltransferase  39.29 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  0.794876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  29.44 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1290  serine O-acetyltransferase  30.86 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0302929  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  34.17 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  32.88 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0080  serine acetyltransferase  37.8 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4136  serine acetyltransferase  37.8 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0074  serine acetyltransferase  37.8 
 
 
274 aa  74.7  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.26 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  38.39 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  30.26 
 
 
273 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>