More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2468 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
175 aa  356  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  96.57 
 
 
175 aa  345  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  43.75 
 
 
173 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  43.3 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  36.87 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  39.77 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  39.66 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  41.04 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  40.34 
 
 
260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 
174 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
229 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  36.52 
 
 
205 aa  107  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
217 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  36.52 
 
 
242 aa  105  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  35.71 
 
 
221 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  40.52 
 
 
181 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
220 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  38.64 
 
 
238 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  39.76 
 
 
240 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  34.46 
 
 
228 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  36.99 
 
 
257 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  37.87 
 
 
258 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  34.86 
 
 
223 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  38.07 
 
 
240 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0082  serine O-acetyltransferase  39.11 
 
 
248 aa  101  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  34.62 
 
 
255 aa  101  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  36.69 
 
 
258 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  38.01 
 
 
253 aa  101  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  36.69 
 
 
258 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  36.21 
 
 
169 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  36.9 
 
 
237 aa  101  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  36.57 
 
 
222 aa  100  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  36.26 
 
 
259 aa  101  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  37.08 
 
 
174 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  36.09 
 
 
258 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
248 aa  99.8  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  36.21 
 
 
247 aa  99.8  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.58 
 
 
173 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  34.88 
 
 
265 aa  99  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  37.13 
 
 
243 aa  99  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  37.08 
 
 
249 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  36.52 
 
 
174 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1084  Serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
277 aa  99.4  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.183103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  35.63 
 
 
169 aa  99  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  34.83 
 
 
224 aa  99  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  36.91 
 
 
261 aa  98.6  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
242 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
280 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  36.93 
 
 
253 aa  98.2  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  35.96 
 
 
174 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0083  serine O-acetyltransferase  34.44 
 
 
221 aa  97.8  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  33.91 
 
 
244 aa  97.4  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  36.14 
 
 
273 aa  97.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  34.29 
 
 
260 aa  97.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  34.41 
 
 
275 aa  97.8  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  34.27 
 
 
223 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
268 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  36.47 
 
 
169 aa  97.1  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  34.88 
 
 
263 aa  97.1  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  34.83 
 
 
221 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  34.88 
 
 
263 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
268 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  38.78 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  37.89 
 
 
239 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  38.78 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  32.79 
 
 
259 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  35.5 
 
 
261 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  39.16 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  38.46 
 
 
273 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  34.32 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  34.08 
 
 
191 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 
221 aa  95.5  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18291  Serine acetyltransferase  32.76 
 
 
244 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.095419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  33.71 
 
 
221 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  33.89 
 
 
271 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  33.69 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  35.58 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  33.52 
 
 
247 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
222 aa  95.1  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  36.87 
 
 
247 aa  95.5  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  36.02 
 
 
241 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  34.73 
 
 
268 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  39.31 
 
 
273 aa  95.1  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  35.76 
 
 
273 aa  95.5  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>