More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3842 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
215 aa  420  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.08 
 
 
175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  39.08 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  41.4 
 
 
205 aa  112  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  34.22 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  41.1 
 
 
226 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  43.04 
 
 
170 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.27 
 
 
175 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  40.91 
 
 
228 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  38.65 
 
 
240 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  40.24 
 
 
191 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  42.58 
 
 
275 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  36.81 
 
 
223 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  40.94 
 
 
273 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  38.64 
 
 
264 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  38.64 
 
 
249 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0082  serine O-acetyltransferase  35.59 
 
 
183 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0605455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  41.45 
 
 
173 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  41.51 
 
 
229 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  43.22 
 
 
248 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
237 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
173 aa  102  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
222 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.16 
 
 
174 aa  101  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  36.61 
 
 
195 aa  101  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  41.45 
 
 
268 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  39.39 
 
 
221 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0083  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  38.65 
 
 
221 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  38.12 
 
 
273 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3035  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 
261 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.718  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  37.3 
 
 
273 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18291  Serine acetyltransferase  38.65 
 
 
244 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.095419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3325  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
243 aa  98.6  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  40.62 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  40.62 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0718  serine O-acetyltransferase  36.75 
 
 
183 aa  98.6  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.052747  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  39.26 
 
 
273 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  39.75 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  39.18 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  37.11 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  38.16 
 
 
172 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  43.33 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18481  Serine acetyltransferase  38.04 
 
 
244 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  38.18 
 
 
223 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  38.18 
 
 
224 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1389  serine O-acetyltransferase  38.61 
 
 
194 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.0958041 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  43.33 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  36.88 
 
 
230 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  37.65 
 
 
175 aa  97.1  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  36.76 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1731  Serine acetyltransferase  38.46 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0728275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  37.23 
 
 
273 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  37.01 
 
 
174 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  37.04 
 
 
249 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  38.6 
 
 
273 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1726  serine O-acetyltransferase  40.11 
 
 
256 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.410089  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  46.43 
 
 
169 aa  95.5  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  47.32 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  37.67 
 
 
174 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  33.13 
 
 
258 aa  95.1  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  37.67 
 
 
174 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  38.18 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  36.25 
 
 
174 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  36.75 
 
 
240 aa  94.7  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  35.26 
 
 
191 aa  94.4  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  38.61 
 
 
273 aa  94  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0177  serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 
227 aa  94  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.635275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1321  serine O-acetyltransferase  46.43 
 
 
169 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553891  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  40.52 
 
 
280 aa  94  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 
175 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  39.87 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  36.21 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2139  serine O-acetyltransferase  37.97 
 
 
259 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0969839 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  39.1 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  38.12 
 
 
254 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  38.61 
 
 
259 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 
273 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
273 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  38.12 
 
 
233 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  46.9 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 
194 aa  93.2  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  37.42 
 
 
247 aa  92.8  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  34.78 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  34.78 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  36.81 
 
 
257 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>