More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1960 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  40 
 
 
184 aa  109  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  38.69 
 
 
245 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  38.69 
 
 
245 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  34.46 
 
 
184 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1817  serine O-acetyltransferase  40.54 
 
 
176 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  37.8 
 
 
223 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  36.61 
 
 
215 aa  101  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  39.62 
 
 
188 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  37.35 
 
 
258 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  36.14 
 
 
226 aa  94.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  35.15 
 
 
228 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  36.97 
 
 
240 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
309 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  38.98 
 
 
302 aa  93.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  38.36 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  36.48 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  36.02 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  35.03 
 
 
222 aa  91.7  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  39.39 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
222 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4978  serine O-acetyltransferase (serine acetyltransferase)  38.31 
 
 
344 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0115  hexapeptide transferase family protein  41.38 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000250738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0476  serine O-acetyltransferase  32.28 
 
 
224 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1005  serine O-acetyltransferase  39.42 
 
 
163 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.976696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  32.95 
 
 
172 aa  89.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1898  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.03 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1845  serine acetyltransferase-like protein  41.88 
 
 
164 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17661  Serine acetyltransferase  35.37 
 
 
249 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  33.73 
 
 
252 aa  89  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  34.34 
 
 
230 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1731  Serine acetyltransferase  35.37 
 
 
245 aa  88.6  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0728275  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.95 
 
 
174 aa  88.6  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
225 aa  88.6  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0082  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 
248 aa  88.6  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01521  Serine acetyltransferase  37.35 
 
 
247 aa  87.8  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  37.27 
 
 
273 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1690  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.57 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0534677  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  34.34 
 
 
263 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  34.34 
 
 
263 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4791  serine O-acetyltransferase  34.46 
 
 
213 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312597  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  34.34 
 
 
261 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 
273 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  35.22 
 
 
261 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  35.22 
 
 
261 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1106  serine O-acetyltransferase  45.22 
 
 
125 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.560479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  35.22 
 
 
261 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 
247 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18271  Serine acetyltransferase  34.76 
 
 
244 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.457811  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  37.87 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1733  Serine O-acetyltransferase  34.81 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0102329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  35.62 
 
 
268 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  35.85 
 
 
258 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.29 
 
 
175 aa  86.3  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 
273 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  33.9 
 
 
222 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 
273 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  36.64 
 
 
170 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  37.21 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3953  Serine O-acetyltransferase  35.93 
 
 
250 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0171272  hitchhiker  0.00273394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  34.36 
 
 
242 aa  85.5  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  33.54 
 
 
260 aa  85.5  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20921  Serine acetyltransferase  35.54 
 
 
250 aa  85.5  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.869506 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3216  serine O-acetyltransferase  37.27 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.52 
 
 
173 aa  85.9  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  38.93 
 
 
253 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3255  serine O-acetyltransferase  37.27 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  37.21 
 
 
264 aa  85.5  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  36.31 
 
 
273 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1371  Serine acetyltransferase-like  37.06 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105328  normal  0.270521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  33.9 
 
 
256 aa  85.5  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  36.31 
 
 
273 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  38.71 
 
 
221 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  34.94 
 
 
257 aa  85.1  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18481  Serine acetyltransferase  32.77 
 
 
244 aa  85.1  6e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  35.4 
 
 
273 aa  84.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  35 
 
 
225 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  34.46 
 
 
244 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.63 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  36.62 
 
 
173 aa  84.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  38.71 
 
 
221 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  35.44 
 
 
273 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  35.1 
 
 
177 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1357  satase isoform II  34.97 
 
 
176 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  33.13 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1621  Serine O-acetyltransferase  34.21 
 
 
281 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.645411  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  35.15 
 
 
259 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  32.39 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18291  Serine acetyltransferase  32.2 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.095419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  35.67 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  33.75 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3701  serine O-acetyltransferase  33.92 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  34.59 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  35.67 
 
 
273 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>