More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0883 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 261 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  98.08 
 
 		 261 aa  526  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  97.7 
 
 		 261 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  95.79 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  83.91 
 
 		 258 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  83.72 
 
 		 258 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  84.74 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  86.64 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  84.62 
 
 		 258 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  83.81 
 
 		 258 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  79.76 
 
 		 259 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  70.45 
 
 		 259 aa  367  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  62.4 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  64 
 
 		 273 aa  347  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  61.07 
 
 		 273 aa  344  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  62.35 
 
 		 274 aa  344  8.999999999999999e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  61.07 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  61.07 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  61.07 
 
 		 273 aa  343  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  61.07 
 
 		 273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  60.31 
 
 		 273 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  60.31 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  60.31 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  60.31 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  62.25 
 
 		 269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  62.65 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  62.55 
 
 		 258 aa  332  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  59.3 
 
 		 273 aa  331  9e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  59.29 
 
 		 273 aa  328  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  57.09 
 
 		 273 aa  324  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  65.18 
 
 		 268 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  63.93 
 
 		 260 aa  319  3e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  62.25 
 
 		 280 aa  319  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  63.05 
 
 		 252 aa  318  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  56.98 
 
 		 273 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  63.95 
 
 		 275 aa  311  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  56.11 
 
 		 273 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  64.44 
 
 		 249 aa  311  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  61.57 
 
 		 261 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  59.04 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  63.09 
 
 		 250 aa  298  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  64.66 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  61.74 
 
 		 280 aa  295  4e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  59.39 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1210  serine O-acetyltransferase  54.81 
 
 		 303 aa  285  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1180  serine O-acetyltransferase  54.44 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1097  serine O-acetyltransferase  58.1 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.486928 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  59.34 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1003  serine O-acetyltransferase  58.1 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169467  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  62.56 
 
 		 225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  60.94 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  60.94 
 
 		 267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2551  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2165  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1662  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2686  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145985  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3151  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2602  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1438  serine O-acetyltransferase  61.37 
 
 		 261 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  60.94 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  60.52 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  60.94 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1936  serine O-acetyltransferase  60.09 
 
 		 260 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0874161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  60.94 
 
 		 257 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  57.31 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  59.66 
 
 		 267 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  57.66 
 
 		 278 aa  278  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1244  serine O-acetyltransferase  51.09 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000603687  normal  0.0426747 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1621  Serine O-acetyltransferase  57.77 
 
 		 281 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.645411  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  57.2 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  58.74 
 
 		 233 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1080  serine O-acetyltransferase  55.73 
 
 		 247 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0884216  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  59.82 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  58.04 
 
 		 237 aa  268  5e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  53.46 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  60.45 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  60.45 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  57.14 
 
 		 263 aa  266  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  59.28 
 
 		 230 aa  266  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  58.01 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  54.88 
 
 		 259 aa  265  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  52.14 
 
 		 254 aa  265  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  56.71 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  53.75 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  56.95 
 
 		 225 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  54.46 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  54.46 
 
 		 222 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  57.87 
 
 		 265 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  56.54 
 
 		 252 aa  259  4e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  56.22 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  56.1 
 
 		 274 aa  254  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  56.33 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01650  nitrogen fixation serine O-acetyltransferase CysE1  54.89 
 
 		 265 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1830  serine acetyltransferase  55.45 
 
 		 249 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  55.2 
 
 		 221 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  50.82 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  50.82 
 
 		 258 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  54.75 
 
 		 221 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  54.38 
 
 		 314 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0453  serine O-acetyltransferase  55.25 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>