More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1012 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
174 aa  353  8.999999999999999e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  80.95 
 
 
172 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  79.88 
 
 
173 aa  288  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  67.9 
 
 
174 aa  237  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  67.28 
 
 
174 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  67.28 
 
 
174 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  62.79 
 
 
174 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  62.79 
 
 
173 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1436  serine acetyltransferase CysE, putative  57.89 
 
 
170 aa  195  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  42.77 
 
 
177 aa  151  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  40.76 
 
 
184 aa  124  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.46 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  36.16 
 
 
229 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1174  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.87 
 
 
162 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01964  predicted acyl transferase  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1599  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1004  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89582  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1583  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01953  hypothetical protein  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2351  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2993  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  39.22 
 
 
162 aa  103  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  31.84 
 
 
273 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  30.73 
 
 
273 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  30.73 
 
 
273 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  38.16 
 
 
215 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  30.73 
 
 
273 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
252 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
228 aa  101  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  30.17 
 
 
273 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5217  serine O-acetyltransferase  32.58 
 
 
221 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000292465  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  33.53 
 
 
280 aa  99.8  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.88 
 
 
175 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
261 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  35.29 
 
 
261 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  30.17 
 
 
273 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  30.17 
 
 
273 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  30.17 
 
 
273 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0109  serine O-acetyltransferase  32.58 
 
 
221 aa  99  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  36.14 
 
 
221 aa  98.6  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.6 
 
 
162 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2672  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  36.6 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0083  serine O-acetyltransferase  32.58 
 
 
221 aa  98.6  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00127612  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  39.71 
 
 
175 aa  98.2  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  40 
 
 
223 aa  98.2  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  30.17 
 
 
273 aa  97.8  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  35.21 
 
 
273 aa  97.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  34.07 
 
 
263 aa  97.4  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  34.07 
 
 
263 aa  97.4  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  34.71 
 
 
261 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  32.61 
 
 
273 aa  97.4  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  34.71 
 
 
261 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  31.84 
 
 
273 aa  97.4  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
191 aa  97.4  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  31.76 
 
 
224 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.27 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  31.76 
 
 
223 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.95 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  35.37 
 
 
260 aa  97.1  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  35.56 
 
 
205 aa  97.1  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.95 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  39.19 
 
 
222 aa  97.1  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  35.54 
 
 
240 aa  96.7  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.95 
 
 
162 aa  97.1  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  37.66 
 
 
230 aa  97.1  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  35.21 
 
 
273 aa  96.3  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  36.17 
 
 
258 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
240 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  30.73 
 
 
273 aa  96.3  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  40.71 
 
 
238 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  37.23 
 
 
225 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09440  serine O-acetyltransferase  35.06 
 
 
195 aa  95.9  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.33324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  37.01 
 
 
258 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1290  serine O-acetyltransferase  37.84 
 
 
237 aa  95.5  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0302929  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0927  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 
230 aa  95.9  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  32.35 
 
 
273 aa  95.5  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  37.95 
 
 
220 aa  95.1  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7395  serine O-acetyltransferase  39.04 
 
 
176 aa  95.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396257 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5910  hexapaptide repeat-containing transferase  39.04 
 
 
176 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.787175 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  40.69 
 
 
169 aa  95.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0099  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.6707700000000002e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0088  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00228482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0088  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0085  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00846458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0084  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0119  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000122226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  37.59 
 
 
233 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0088  serine O-acetyltransferase  32.02 
 
 
221 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000145042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  35.98 
 
 
275 aa  94.7  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3564  serine O-acetyltransferase  32.97 
 
 
256 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  36.17 
 
 
258 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  34.24 
 
 
250 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1293  serine acetyltransferase CysE, putative  35.76 
 
 
180 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  46.96 
 
 
175 aa  94.4  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  38.41 
 
 
226 aa  94.4  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6178  hexapaptide repeat-containing transferase  39.04 
 
 
176 aa  94.4  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  36.14 
 
 
217 aa  94.4  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  35.42 
 
 
225 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3107  serine O-acetyltransferase  37.09 
 
 
253 aa  93.6  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000903584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  38.35 
 
 
264 aa  93.6  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0083  serine O-acetyltransferase  31.46 
 
 
221 aa  93.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>