More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3892 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  82.54 
 
 
218 aa  331  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  81.61 
 
 
177 aa  299  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  34.83 
 
 
238 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  38.37 
 
 
177 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  41.18 
 
 
275 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  38.16 
 
 
258 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0951  serine O-acetyltransferase  37.22 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2578  Serine acetyltransferase-like protein  40 
 
 
174 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2909  serine O-acetyltransferase  39.88 
 
 
174 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3136  serine O-acetyltransferase, putative  40 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.901166  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  39.86 
 
 
268 aa  95.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  39.22 
 
 
225 aa  94  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2719  serine O-acetyltransferase  38.79 
 
 
174 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.395026  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  36.3 
 
 
273 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  39.46 
 
 
258 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  37.25 
 
 
273 aa  93.2  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  36.59 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  36.59 
 
 
245 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  33.99 
 
 
273 aa  92.8  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  37.67 
 
 
280 aa  92.8  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  39.46 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  39.19 
 
 
229 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  33.99 
 
 
273 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  33.99 
 
 
273 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  33.99 
 
 
273 aa  92.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  31.72 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  38 
 
 
261 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.54 
 
 
173 aa  92  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  38 
 
 
261 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  37.91 
 
 
261 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  34.64 
 
 
273 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  39.6 
 
 
247 aa  91.3  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  35.26 
 
 
309 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  39.22 
 
 
273 aa  91.7  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  37.33 
 
 
261 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  37.33 
 
 
261 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0082  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 
248 aa  90.9  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  37.75 
 
 
250 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  38 
 
 
262 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  38 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  36.72 
 
 
259 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  38 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  36.05 
 
 
269 aa  89.4  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0954  Serine O-acetyltransferase  33.11 
 
 
175 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  36.49 
 
 
182 aa  89  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  36.36 
 
 
252 aa  89  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  35.71 
 
 
273 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  35.53 
 
 
274 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  35.8 
 
 
173 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  37.25 
 
 
258 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  35.95 
 
 
267 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1670  serine O-acetyltransferase  34.29 
 
 
194 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.390403  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  33.13 
 
 
172 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4306  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 
202 aa  87.8  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  39.04 
 
 
228 aa  87.8  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  36.99 
 
 
258 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  36.91 
 
 
288 aa  87  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.73 
 
 
174 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  39.31 
 
 
242 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  42.34 
 
 
241 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  35.14 
 
 
273 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  35.06 
 
 
258 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
280 aa  85.9  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  33.92 
 
 
273 aa  85.9  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0402  serine O-acetyltransferase  39.42 
 
 
229 aa  85.1  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000226719  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  41.45 
 
 
267 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  34.86 
 
 
253 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  41.45 
 
 
267 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  34.86 
 
 
253 aa  85.1  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  40.79 
 
 
267 aa  85.1  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  40.79 
 
 
257 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  40.79 
 
 
257 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  36.6 
 
 
259 aa  84.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  34.72 
 
 
273 aa  84.7  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1472  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
230 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  40.79 
 
 
257 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  32.04 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0840  serine O-acetyltransferase  37.58 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  36 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  40.14 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1767  serine O-acetyltransferase  35.09 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.149878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  34.81 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  29.76 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6012  putative hexapeptide transferase family protein  37.93 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493512  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  41.5 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  35.26 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  40.41 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  36.3 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0085  serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0089  serine O-acetyltransferase  37.93 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000290545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  35.33 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0565  serine O-acetyltransferase  38.1 
 
 
215 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0551  serine O-acetyltransferase  38.1 
 
 
215 aa  82  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>