More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3564 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3564  serine O-acetyltransferase  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  81.51 
 
 		 265 aa  432  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  80.31 
 
 		 259 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  78.71 
 
 		 263 aa  407  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  78.71 
 
 		 263 aa  408  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  79.23 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  76.45 
 
 		 259 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  75.49 
 
 		 257 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  69.34 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  66.27 
 
 		 256 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  65.25 
 
 		 259 aa  334  7.999999999999999e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  61.18 
 
 		 268 aa  321  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1097  serine O-acetyltransferase  64.73 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.486928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  64.31 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1003  serine O-acetyltransferase  64.32 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169467  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1080  serine O-acetyltransferase  62.75 
 
 		 247 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0884216  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  63.76 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3151  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1662  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2686  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2165  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2551  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1438  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2602  serine O-acetyltransferase  63.48 
 
 		 261 aa  289  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  62.96 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  62.96 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  61.32 
 
 		 252 aa  287  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  62.96 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  63.91 
 
 		 280 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  61.67 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  62.96 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  62.96 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  61.73 
 
 		 278 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  61.32 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1936  serine O-acetyltransferase  62.01 
 
 		 260 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0874161  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1621  Serine O-acetyltransferase  60.16 
 
 		 281 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.645411  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  53.52 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  52.92 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  51.35 
 
 		 259 aa  255  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  53.54 
 
 		 258 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  53.54 
 
 		 258 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  51.72 
 
 		 260 aa  250  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  55.6 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  55.22 
 
 		 258 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  49.61 
 
 		 250 aa  248  7e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  51.91 
 
 		 261 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  52.14 
 
 		 258 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  51.91 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  53.71 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  50.58 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  53.15 
 
 		 259 aa  242  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  51.91 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  52.55 
 
 		 258 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  51.97 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  54.89 
 
 		 261 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  53.25 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  53.02 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  49.2 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  50.43 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  53.74 
 
 		 264 aa  229  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  53.74 
 
 		 249 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  51.27 
 
 		 280 aa  228  5e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  49.35 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1244  serine O-acetyltransferase  46.07 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000603687  normal  0.0426747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  48.07 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  48.07 
 
 		 273 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  48.07 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  45.91 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  45.91 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  45.91 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  47.64 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  45.91 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  45.91 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  50.88 
 
 		 237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  51.33 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  52.38 
 
 		 226 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  45.92 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  50.66 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  47.62 
 
 		 267 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  50.45 
 
 		 229 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  53.67 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  50.67 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  48.35 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  48.35 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  50.23 
 
 		 228 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  50.88 
 
 		 230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  44.36 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  45.42 
 
 		 273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1180  serine O-acetyltransferase  46.67 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1210  serine O-acetyltransferase  47.06 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20921  Serine acetyltransferase  44.71 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.869506 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  50.46 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  49.78 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  45.06 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  47.39 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  48.03 
 
 		 238 aa  207  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0845  serine O-acetyltransferase  51.92 
 
 		 221 aa  207  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000173801  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1397  Serine O-acetyltransferase  46.3 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11781  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  49.58 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  43.78 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>